D'accord, bei den 5mm würde ich jetzt auch nicht anfangen weiter drüber nachzudenken über die Sattelhöhe (außer bei einem Kurbelwechsel logischerweise).
Allerdings die 5cm in der Horizontalen sind wie erwähnt eine ganze Menge... und der Ort Deines unangenehmen Gefühls (vielleicht auch zu beschreiben wie ein Brennen?) hinter der Kniescheibe passt meines Erachtens dazu: das spricht idR für einen zu hoch eingestellten Sattel - oder eben auch für einen, der zu weit nach hinten geschoben ist, der Effekt ist quasi der gleiche: zu grosse Durchstreckung des Knies.

Auf Pedalachsen und Kniestellung dazu würde ich allerdings nicht allzuviel Wert legen bzw. wenn nur als Anfangswert heranziehen... jeder Jeck ist anders (insbesondere: Verhältnis Unterbein zu Oberbeinlänge) und wichtiger ist meines Erachtens, besonders für Langstreckengemütlichkeit, hier darauf wert zu legen, dass man gewichtsmässig ausbalanciert ist - soll heißen: mit der Sattelstellung in der horizontalen stelle ich mir lieber meinen Schwerpunkt so ein, dass ich in der hauptsächlich genutzen Fahrposition weder am Lenker ziehen noch mich mit den Händen groß abstützen muß auf dem Lenker, um nicht nach vorne oder hinten wegzukippen (wenn der Oberkörper nach vorne geneigt wird, muß der Po weiter nach hinten, um im Gleichgewicht zu bleiben - einfach mal so ohne Rad im Stehen ausprobieren).

Aber wer weiß, eine kürzere Kurbel mag vielleicht das Problem auch lösen - wobei ich das wie gesagt nicht überbewerten würde... hab zwar letztes Jahr selber erst die Erfahrung gemacht, dass ich mit 175er Kurbeln schneller fahren kann als mit 170er (wie sie zuvor an meinem Alltagsrad dran war), nebenbei bei fast gleicher Innenbeinlänge wie Du (hab so 88 bis 89cm)... allerdings hab ich erst heute wieder die Erfahrung gemacht, dass 5mm Sattelhöhe niedriger/höher durchaus ähnliche Effekte haben können (der Erschöpfungsgrad nahm jedes Mal rapide zu bei sichtlich niedrigerem Schnitt, blöderweise aber ohne sonstige Beschwerden, an denen man das festmachen könnte). Achja, und dass höhere Kadenzen (Trittgeschwindigkeit) mit der kürzeren Kurbel leichter zu halten waren - anfangs mit der 175er waren die vorher problemlosen und gewohnten +-90 UpM echt eine Qual zu halten. Bemerkbar macht sich das also schon durchaus.