Ich wohne in der Nähe, bin ihn aber noch nicht komplett gefahren. Allerdings kenne ich etliche Abschnitte von anderen Touren. Ich würde in Regensburg beginnen und Donau aufwärts nach Kelheim. Dort unbedingt mit dem Schiff durch den Donaudurchbruch und wieder zurück. RMD Kanal aufwärts, alten Kanal bis Neumarkt (sehr idyllisch). Wenn Du den Großstadtverkehr meiden willst, nimm ab Feucht die S-Bahn. Nürnberg raus Richtung Osten geht sehr bald am Fluss, das fand ich entspannt.
Wenn dann die größte Steigung in der Oberpfalz kommt, seid ihr schon ein bisschen trainiert.
Übernachtung: da habe ich keine eigenen Erfahrungen, aber bedenke, dass zu der Zeit Sommerferien in Bayern sind.

Gruß Gerhard