Ich glaube, daß es von Basel auch ECs gibt, die man bis Milano durchbuchen kann (Velo). Das Umsteigen in Chiasso in die ital. Nahverkehrswracks ist nicht extrem lustfördernd. Kann aber sein, daß das nicht mehr geht.
Nahverkehrs-/Eilzüge von Mailand nach Chiasso sind oft identisch mit denen in der Schweiz und fahren auch z.T. von Lugano bis Mailand. Interessant: In Mailand gibt es Multibahnhofswirtschaft und so z.T. Züge von jedem der beiden wichtigsten Bahnhöfe in die Schweiz.