Von Stein am Rhein über Zürich und dann der Limmat folgen ist sicher eine schlechte Idee, zumal die westliche Ausfahrt keine schöne Gegend ist (Gewerbe, Industrie, dichte Besiedlung). Man kann ja weitgehend einfach am Hochrhein bis zur Aare-Mündung und dann der Aare folgen, bis man zu den großen Seen am Jura-Rand abzweigt. Von dort geht es dann nach Lausanne oder Morges - sofern es dann genug Genfer See ist, wenn man bis Genf radelt. Für den heißen Sommer wäre es besser Höhen- und Waldroutenrouten im Jura zu fahren - das lässt sich aber nicht mit Bergverweigerung vereinbaren. Über Chalon-s-Saône wäre ja ohne Genfer See - ich dachte, das wäre gesetzt.

Ich selber würde ja mal was anderes empfehlen, und der Aare bis Bern folgen, dann durch das Freiburger Land/Lac de la Gruyère über den Lac d'Hongrin nach Yvorne/Aigle und dann zum Genfer See mit kompletten Süd- oder Nordufer. Das beinhaltet aber einen recht anspruchsvollen Anstieg, der übrigens sehr schattig wäre und ungemein verkehrsarm (auch nationale Veloroute).