Die Angabe von Höhenmetern ist in der Tat stark fehlerbehaftet. Das liegt nicht nur am Messen, sondern auch an der Definition, was man darunter überhaupt versteht.
Deine beiden Messungen liegen keine 10% auseinander.

Das ist eine völlig ausreichende Genauigkeit. Besser geht es rein prinzpiell nicht.

Kleine Episode am Rande - genau deshalb sträuben sich die Veranstalter von Radrennen bis hin zur Tour de France, für die Etappen offizielle Höhenmeter anzugeben.

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Nun zur Frage - ja, sicherlich ist das windabhängig. Aber wie gesagt - plusminus 10% ist noch völlig okay.
Gruß
Thoralf