Auch gute Biegeroboter haben gewisse Toleranzen und bei Tubus hatte ich schon öfters leicht verzogene Träger (was ich aber nicht für ein Problem halte). Wenn die entsprechenden Bohrungen schon eine Überdeckung haben liegt der Verzug unter 5mm, soviel Spannung sollte bei der Montage egal sein. Aber drücke den Träger währenddessen auf jeden Fall so hin, dass Du die Schraube mit den Fingern eindrehen kannst, sonst versaust Du das Gewinde!
Ach, ein gewisser Verzug, Asymmetrie oder verdrehte Gewindebuchsen bei der Gabel wären auch kein ungewöhnliches Szenario, ein renommierter Fahrradhersteller wollte mir eine Gabel andrehen, bei der die Lowriderbuchsen ~10° nach vorne verdreht eingelötet waren