Den Nationalpark-Radweg kann ich dir nicht empfehlen. Der ist etwas für Genussradler, die sich in der Natur erholen wollen. Die Streckenführung ist verwinkelt, man ist oft auf Forststraßen.

Die Sumavska Magistrala ist meiner Meinung nach für euch ideal. Die verläuft zwar teilweise auf Nebenstraßen, aber mit wenig Kfz-Verkehr.
Auf deutscher Seite sind die entsprechenden Straßen deutlich voller.

Grüße
Gregor