Diese Abweichungen sind völlig normal, relativ gering und technisch bedingt nicht anders möglich. GPS-Höhenmetermessung (in Bewegung) ist immer ungenau. Höhenmeterberechnung aus dem digitalen 90 m-Höhenmodell ebenso. Auch zwei nebeneinander montierte Geräte zeigen niemals völlig identische Werte an, weil es natürlich trotzdem Unterschiede beim Empfang der Satellitensignale gibt. Ein unterschiedlich gemessenes Signal kann schon 25 m Differenz ausmachen. Sind die Geräte technisch verschieden, überlagern das Ergebnis noch softwarebedingte Auswertungsdifferenzen. Wenn Du es genauer haben willst, verwende bei stabiler Wetterlage den Wert eines guten barometrischen Höhenmessers.