Hallo Franz,
kann dir sehr die folgende Teilstrecke empfehlen:
von Cesky Krumlov aus an der Moldau (und am Lipno-Stausee) entlang dann weiter bis zum Grenzübergang Haidmühle, von dort geht ein Radweg auf ehemaliger Bahntrasse hinunter nach Waldkirchen.
Gruß, Heiner