Wandern würde ich eher nach der Radtour als vorher. Ich hätte nach zwei Wochen Wandern wahrscheinlich zuviel Muskelkater, um noch gemütlich radzufahren.
Sonst würde ich es etwas von der An-/Abreise abhängig machen. Mit der Bahn würde ich auf jeden Fall Ost-West empfehlen, weil man von Lindau schnell in Ehingen ist, das geht auch noch am späteren Abend. Nach/von Bayern mit der Bahn ein- oder ausreisen hat so seine Tücken (Ausland!
), Berchtesgaden liegt auch nicht am Nabel der Welt. Würde daher die "beschwerliche" Anreise eher nach vorne legen als an den Schluss. Mein Tipp wäre übrigens von Salzburg zu starten, via Anif oder Grödig kommt man einigermaßen leicht nach Marktschellenberg und Berchtesgaden. Dann erlebt man die Öffnung zu den Bergen und zum Watzmann recht eindrucksvoll. Zudem ist man mit dem IC recht flott in Salzburg (kein Ausland, da deutsch-japanische Besatzungszone
) - das ist überschaubar. Man kann auch noch mit Rad an der Salzach bis Hallein und dann über den Berg, das ist aber schon steiler.