Schau mal ins Radreise-Wiki (Link in der Spalte links), da findest schon eine Menge Infos. Sollten dann Fragen offen sein, einfach mal nach älteren Beiträgen suchen und konkrete Fragen stellen, falls noch Klärungsbedarf ist.
Für Brenner - Innsbruck braucht man keinen Planer, da geht's einfach immer auf der Strasse bergab.
Warum den Inn runter nach Kufstein? Das vermeidet zwar Höhenmeter, führt aber zwangsläufig zu einer deutlich längeren Route. Der kürzere Weg führt Richtung Allgäu.
Für Bayern, Hessen und NRW gibt es Online-Planer für Radfernwege, für Baden-Württemberg und Rheinland-Pfalz nicht (ist für letzteres auch nicht nötig, da geht's immer am Rhein lang).
Gruß
Uli