Ich weiss nicht ob es offizielle Stellplätze gibt, aber ich bin auch schon von Prag nach Zürich mit den Fahrrädern im Nachtzug gefahren ohne Stellplatz. Wir hatten damals zwei 3er Abteile für 4 Personen mit 3 Rädern gebucht (einer war mit dem Zug angereist). Das klappte ohne Probleme. Einfach im einen Abteil die unteren beiden Better hochgeklappt und da die Fahrräder aufgestellt.
Wenn du bei Google die Bilder aus dem Zug anschaust (
Link) kannst du vielleicht besser abschätzen ob das in diesem Zug auch klappen könnte... Oder du gehst einmal den Zug vor der Abfahrt in Berlin anschauen und buchst dann entsprechend... (z.b. 1 4er Abteil für 2 Personen mit 2 Fahrrädern)