Wenn du den Track in Mapsource zweimal anklickst, wird dir doch die Liste mit jedem gespeicherten Punkt gezeigt. Lösche einfach soviele Punkte, am Ende oder Anfang, wie du magst und dann hast du einen Teiltrack.
Den solltest du natürlich nicht unter demselben Namen speichern wie den Quelltrack.
Also nicht "speichern", sondern "speichern unter" oder vielleicht heißt es auch "speichern als" wählen.