Zur Not kannst Du auch von Malpensa nach Como mit dem Rad fahren, ist keine Riesenentfernung.
Die Veloroute 3 verläuft von Chiasso nach Basel, nicht nach Bern. Um nach Bern zu kommen, müsstest Du irgendwo nach "links" = Westen abbiegen, das lässt sich fast überall machen, je nach dem, wie bergig Du es magst.
Was verstehst Du unter "knaller Strecke"? Von Chiasso bis zum Lago di Lugano ist die Veloroute 3 eher unschön, das liegt am etwas verbauten Mendrisiotto. Um den Luganer See herum ist es wieder sehr schön, den Monte Ceneri hinauf so la la, der Pass ist fürchterlich hässlich, aber die Route verläuft glücklicherweise meist abseits der Straße. Die Strecke bis zum Gotthardpass ist wieder ganz schön, bis Faido häufig abseits der befahrenen Straßen, ab Faido noch Streckenweise. Gotthardpass ist halt der Gotthardpass, seit langem einer der wichtigsten Pässe über die Alpen, dementsprechend verbaut ist das Tal mit Bahn, Autobahn, Kantonsstraße etc. Historisch nicht uninteressant, wenn man weiß, was man sehen will (und das auch findet). Bergab geht es bergab, ist halt ein Pass
Weiter geht es dann entlang des Urner- und Vierwaldstätter Sees bis Luzern (mit Fähre), von Luzern wieder auf Nebenstrecken durch das Luzerner und Aargauer Mittelland nach Aarau, dann nochmal recht steil z. T. auf Feldwegen über den Jura nach BAsel.

Mein Reisebericht, z. T. auf dieser STrecke, ist hier nachzulesen .


Gruß
Holger