Hallo Christoph,

die Schaltung enthält keine empfindlichen Teile, und Feuchtigkeit wird den Betrieb nicht stören.
Du könntest die fertige Schaltung mit Plastikspray einsprühen (mehrere Durchgänge), wobei der Kühlkörper des Spannungsreglers nicht beschichtet werden sollte.
Ansonsten sind Ablauflöcher statt eines komplett dichten Gehäuse eine gute Wahl - das ist wesentlich einfacher, als das Gehäuse wirklich abdichten zu wollen. Im Falle des Absaufens kann man es immer noch öffnen und das Innenleben trocknen.
Wenn die Akkus voll sind und Du gerade kein Fahrlicht brauchst, kannst Du ja mit Hilfe von eingebauten Widerständen das Gerät trocknen :=)