Hi Frank,
ich glaube, ich habe gerade aehnliche Erfahrungen gemacht:

im Fruehjahr ein neues Rad gekauft, damit verbunden eine bisschen andere Sitzposition, und Anfangs auch Probleme gehabt:
ganz am Anfang waren es starke Verspannungen im Bereich Schulter / Nacken, die Probleme sind dann Etappenweise Rueckenabwaerts bis ins Kreuz gewandert, und jetzt - nach ca 1.000 km - ist alles weg und ich fuehle mich pudelwohl.

Vielleicht war hat auch der Umstieg vom 28er CrossCountry auf ein 26er MTB dazu beigetragen, kann aber nicht beurteilen wieviel Einfluss das hat.

Hoffe, das muntert Dich auf
Christian