Nur bei Rücklichtern? Dann hätte ich eine Erklärung:

Da das rote LED-Licht meist monochromatisch ist, kann es scharfe Beugungsmaxima und -minima an Kanten geben. Ebenso sich überlagernde Reflexionen von Innen- und Außenseite der bedeckenden Scheibe. Wenn das Auto fährt, kommen wechselnd Intensitätsmaxima und -minima an deinem Auge an -> Eindruck des Flackerns.

Bei polychromatischem weißen LED-Licht (und bei Glühbirnen sowieso) fällt das nicht auf.