Wir haben auch gerade eine Transalp mit dem Zial Gardasee hinter uns, deshalb hatte ich mich mit diesem Thema "per Zug zurück nach Deutschland" auch intensiver beschäftigt. Einige Punkte sprachen letztendlich dagegen:
1. Die Zugfahrt ist verhältnismäßig wirklich teuer (ca. 350€ für 2 Personen)
2. Eine Fahrradmitnahme im italienischen Zug kann man laut DB nicht von Deutschland aus buchen, dass bedeutet, niemand kann dir in Deutschland garantieren, dass dein Rad überhaubt in den Zug darf

Schlussendlich haben wir uns für einen Flug entschieden, ab Mailland-Bergamo fliegt Ryanair verschiedene deutsche Städte an. Kosten 100€ für 2 Personen incl. Gepäck etc. Fahrräder kosten 20€ extra und müssen verpackt werden. Ist aber kein Problem, am Flughafen selbst gibt es Packstationen.

Vielleichrt wäre das auch für dich eine Alternative, schließlich ist man ne Stunde später zu Hause.

Gruß
Jan