Der Unterschied liegt aus meiner Sicht darin, das ein kommerzieller Anbieter auf eine hohe Auslastung setzt und bspw. einen quasi leeren Bus nicht anbieten würde. Bei der Bahn sieht das aber anders aus. Bei der (teilweise) staatlich gelenkten Bahn geht es auch um Versorgung. Der Staat will den Deutschland-Takt ja nicht, weil er den ICE jede 30min zwischen HH und B zu 80% voll bekommen würde...

Sprich die Bahn fährt tendenziell mit weniger Auslastung, also weniger Personen, auf die man den CO2-Ausstoss verteilen kann.