Soweit mir bekannt ist, nimmt Flixbus im grenzüberschreitenden Verkehr keine Fahrräder mit.
Mailand - Freiburg hinten auf dem Träger kein Problem. In Freiburg fliegender Wechsel auf den Bus nach Düsseldorf. Umsteigezeit 3 MInuten. Das war angenehmer als die Tortur von Marseille nach Düsseldorf mit TER und RE und 10x Umsteigen.