keine Ahnung, ob meine Fußprobleme vergleichbar sind/waren mit Deinen, bzw. ob es ähnliche Ursachen sind/waren...
Ohne groß ins medizinische Detail zu gehen:
Ich habe meine Fußprobleme (Schmerzen im Sohlenbereich) durch extrem harte Radfahrschuhe gelöst (dafür kann ich mit den Schuhen kaum ein paar Meter laufen...).
Meine Knieprobleme waren nach Einführung von Klickpedalen weg.

Ergänzung noch: Bärentatzen habe ich auch am MTB, aber meine Knieprobleme werden damit nur vermindert.
Ergo, Klickie und harte Sohle sind das A und O (bei mir)