Wären unverwechselbare Steckverbindungen eine Lösung? Damit kann nicht zusammenkommen, was nicht zusammen gehört. Wenn das nicht machbar ist, vielleicht sind unterschiedlichen Farbmarkierungen ein zumindest mittelbarer Schutz?
Wenn ich Dich richtig verstanden habe, dann hast Du die Pufferbatterie mit der Generatorwechselspannung erfreut. Hoffen wir, dass die Zellen das auf längere Zeit wegstecken.